단백질이란 무엇인가 — 한 줄 정의
📖 단백질의 한 줄 정의
"아미노산이라는 작은 분자들이 긴 사슬로 이어진 뒤, 특정한 3D 모양으로 접힌 분자."
풀어 쓰면 세 단계다.
1️⃣ 1차 구조 — 아미노산이 줄줄이
- 아미노산이라는 작은 분자가 20종 있다 (다음 섹션에서 자세히)
- 이걸 일렬로 죽 연결한 사슬이 단백질의 기본 형태
- 길이는 보통 50~2000개 정도 (단백질마다 다름)
- 이 순서를 1차 구조 또는 서열(sequence)이라고 한다
2️⃣ 2차 구조 — 부분적으로 꼬임
- 긴 사슬이 그냥 늘어져 있지 않다
- 특정 부분은 나선(α-helix) 모양으로 꼬이고
- 다른 부분은 주름(β-sheet) 모양으로 평평하게 깔린다
- 이런 부분적인 모양이 2차 구조다
3️⃣ 3차 구조 — 전체가 한 덩어리로 접힘
- 꼬인 부분, 주름진 부분, 그 사이 연결 부분이 다 모여 최종 3D 모양이 된다
- 이게 우리가 "단백질의 구조"라고 부르는 것 — 3차 구조
- 구조 예측이라는 문제는 보통 이 3차 구조를 예측한다는 뜻
💡 핵심 — 구조 예측이라는 문제의 정의
구조 예측 문제는 정확히 이 형태다:
1차 구조(서열) → 3차 구조(3D)
- 입력: 아미노산 글자열 (예: "MALWMRLLPL...")
- 출력: 그 단백질의 모든 원자의 3D 좌표
이게 알파폴드가 푸는 문제다.