단백질 구조 예측 AI,
하나씩 떠먹여드립니다.
생물 시간에 단백질 1차/2차/3차 구조까지만 배워봤다면 충분합니다.
여기서는 로제타폴드(RoseTTAFold)와 ColabFold를
써서 진짜로 단백질 3D 구조를 예측해보는 것까지 함께 갑니다.
GPU 없어도 OK. 구글 계정만 있으면 됩니다.
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챕터
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전체 진도
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GPU 없어도 OK
이 웹북에서 배우는 것
개념부터 실제 실행까지 — 손에 잡히는 순서로 진행합니다.
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📖 시작하기 전에
이 웹북, 어떻게 쓰는 건가요?
⏱ 5분
오리엔테이션
🧬 단백질, 1분 복습
생물 시간에 배운 그거, 맞습니다
⏱ 8분
생물 기초
🔬 옛날엔 어떻게 단백질 모양을 알아냈을까?
X선 결정학 — 노가다와 인내의 시대
⏱ 10분
역사
⏳ 50년간 풀리지 않던 난제
컴퓨터로 구조 예측, 그 험난한 여정
⏱ 10분
역사
⚡ 2020년, 알파폴드가 모든 걸 바꿨다
딥마인드가 만든 충격
⏱ 10분
AI 혁명
🧪 로제타폴드의 등장
Baker 연구실의 카운터펀치
⏱ 10분
AI 혁명
🔤 단백질 시퀀스 읽는 법 (FASTA)
ARNDCEQGHILKMFPSTWYV — 이게 다 뭐임?
⏱ 12분
준비
🧩 MSA — 진화 정보의 마법
비슷한 단백질 수천 개를 동시에 비교하면 답이 보인다
⏱ 12분
AI 비밀
⚙️ 로제타폴드 안에서 무슨 일이 벌어지나
3-track network를 그림으로 풀어봅니다
⏱ 14분
AI 비밀
🎒 돌리기 전에 — 준비물 체크
구글 계정, 시퀀스, 마음의 준비
⏱ 8분
실전 준비
🌐 Robetta 웹서버로 RoseTTAFold 첫 예측
Baker Lab 무료 서버에 시퀀스 던지고 메일로 결과 받기
⏱ 12분
실전
☁️ ColabFold가 뭔데?
Robetta보다 빠른 길 — 구글이 빌려주는 GPU 위에서 직접 돌리기
⏱ 12분
실전
📓 Colab 노트북 사용법 (생물쟁이 첫걸음)
셀, ▶ 버튼, 런타임 — 처음 보는 인터페이스가 안 무섭게
⏱ 14분
실전
▶️ ColabFold 실전 — 셀 하나하나 따라하기
노트북 열고, 시퀀스 넣고, 결과 받기까지 STEP-BY-STEP
⏱ 20분
실전
📄 결과 파일 PDB 읽는 법
ATOM 한 줄에 뭐가 들어있나, pLDDT는 어디 숨어있나
⏱ 12분
결과 해석
이 웹북은 1차 공개분입니다.
챕터 7~17 (MSA, 로제타폴드 아키텍처 상세, ColabFold 실전 실행, 결과 해석, 3D 뷰어)은 곧 추가됩니다.
먼저 1차 공개분을 끝까지 따라오시면 단백질 구조 예측 AI의 큰 그림과 역사를 잡으실 수 있습니다.